1、1985年《放学后》（江户川乱步奖）
2、1986年《毕业》（加贺系列01）
3、1986年《白马山庄杀人事件》
4、1987年《学生街的日子》
5、1988年《11字杀人》
6、1988年《魔球》
7、1988年《以眨眼干杯》
8、1988年《浪花少年侦探团》
9、1989年《悲剧人偶》
10、1989年《沉睡的森林》（加贺系列02）
11、1989年《鸟人计划》
12、1989年《空中杀人现场》
13、1989年《布鲁特斯的心脏》
14、1990年《宿命》
15、1990年《侦探俱乐部》
16、1990年《没有凶手的杀人夜》
17、1991年《假面山庄》
18、1991年《变身》
19、1991年《回廊亭杀人事件》
20、1991年《天使之耳》
21、1992年《大雪中的山庄》
22、1992年《美丽的凶器》
23、1993年《同级生》
24、1993年《分身》
25、1993年《再见了，忍老师》
26、1994年《怪人们》
27、1994年《从前我死去的家》（冷门中最喜欢的一本，没有之一）
28、1994年《造彩虹的人》
29、1995年《平行世界爱情故事》
30、1995年《我晃荡的青春》
31、1995年《怪笑小说》
32、1995年《天空之蜂》
33、1996年《名侦探的守则》
34、1996年《谁杀了他》（加贺系列03）
35、1996年《毒笑小说》
36、1996年《恶意》（加贺系列04）
37、1996年《名侦探的诅咒》
38、1998年《神探伽利略》（汤川系列01）
39、1998年《秘密》（第52届日本推理作家协会奖）
40、1999年《我杀了他》（加贺系列05）
41、1999年《白夜行》（东野大叔的巅峰之作）
42、2000年《只差一个谎言》（加贺系列06）
43、2000年《预知梦》（汤川系列02）
44、2001年《单恋》
45、2001年《超·杀人事件》
46、2001年《圣诞妈妈》
47、2002年《湖畔》
48、2002年《时生》
49、2002年《绑架游戏》
50、2003年《信》
51、2003年《酷酷的代课老师》
52、2003年《杀人之门》
53、2004年《幻夜》
54、2004年《挑战》
55、2004年《仿徨之刃》
56、2005年《黑笑小说》
57、2005年《嫌疑人X的献身》（汤川系列03第134届直木奖第6届本格推理大奖）
58、2005年《科学》
59、2006年《梦回都灵》
60、2006年《红手指》加贺系列07
61、2006年《使命与魂的尽头》
62、2007年《东野圭吾的最后致意》
63、2007年《黎明之街》
64、2007年《瀕死之眼》
65、2008年《流星之绊》
66、2008年《圣女的救济》（汤川04）
67、2008年《伽利略的苦恼》汤川05
68、2009年《悖论13》
69、2009年《新参者》加贺系列08 70、2010年《布谷鸟的蛋是谁的》
71、2010年《白金数据》
72、2010年《雪国之劫》
73、2011年《那时的某人》
74、2011年《盛夏方程式》汤川06
75、2011年《麒麟之翼》加贺09
76、2011年《假面饭店》
77、2012年《歪笑小説》
78、2012年《解忧杂货店》（第7回中央公论文艺奖）
79、2012年《虚像小丑》汤川07
80、2012年《禁忌魔术》汤川08
81、2012年《禁断的魔术》
82、2013年《梦幻花》第26回柴田炼三郎奖
83、2013年《祈祷落幕时》（加贺10第48回吉川英治1文学奖）
84、2013年《疾风回旋曲》
85、2014年《虚无的十字架》
86、2014年《假面前夜》
87、2015年《拉普拉斯的魔女
88、2015年《沉睡的人鱼之家》
89、2015年《风雪追击》
90、2016年《危险的维纳斯》
91、2016年《恋爱的贡多拉》
92、2017年《第十年的情人节》
93、2017年《假面之夜》
94、2018年《魔力的胎动》
95、2018年《沉默的巡游》汤川09来了 没错，这本被宣传的铺天盖地的书不是最新一本
96、2019年《希望之线》新书 国内还没有出版 加贺又客串出场了
97、2020年《祈念之树》国内叫《祈念守护人》
98、2021年《虛像的丑角》汤川10
99､2021年《无名之町》神尾大侦探首秀，上市即登顶四大图书榜单
100.2021年《希望之线》
101．2022年《天鹅与蝙蝠》 作品集39
102．2022年《透明的螺旋》
